Извлечение одного генома из массы генетического материала

Опубликовано: 
27-02-2012

Ученым из Вашингтонского Университета (США) удалось определить 14 видов бактерий, присутствующих в одной капле морской воды. В двух случаях исследователи даже смогли собрать полный геном, включая геном бактерии из группы Euryarchaeota, несмотря на то, что в использованном образце ее ДНК присутствовало меньше всего (7,5%). Ранее было известно, что Euryarchaeota широко распространены среди морских микроорганизмов, но ни один вид этих бактерий не удавалось вырастить в культуре, и тем более секвенировать полный геном.

Данные результаты были получены благодаря специальной компьютерной программе, разработанной Вогном Иверсоном, Ph.D. студентом, работающим в лаборатории Вирджинии Армбраст в Вашингтонском Университете. Данная программа позволяет собрать все обнаруженные отрывки генома в один огромный метагеном. Затем этот геном разбивается на отдельные фрагменты, которые далее распределяются по организмам. В отличие от предыдущих программ, разработанный алгоритм позволяет успешно определить какой фрагмент генома принадлежит определенному микроорганизму.
 
Предполагается, что данный метод анализа может быть использован для изучения особенностей метаболизма, а также экологических аспектов микроорганизмов Мирового Океана. До сих пор плохо исследован состав бактериальных сообществ и взаимоотношения между бактериями в естественной среде.
 
Подготовила Ибрашева Дильбар по материалам статьи: One genome from many
 

Ваш доктор в кармане

Как это работает?

Вам не здоровится?

Мы поможем Вам выявить и лучше понять причины недомогания, а также порекомендуем где и у кого диагностировать, лечить и предупредить болезни

У Вас недомогание? Здесь Вы можете выявить вероятные причины

Здесь Вы узнаете все о болезнях из надежных источников и от мировых экспертов.

Достоверная информация о диагностике, лечении и предупреждении 1000 заболеваний

Где и у кого лечиться: здесь Вы можете сделать правильный выбор. Найти и записаться к нужному врачу в лучшую клинику, рекомендованными другими пациентами

Воспользоваться бесплатно технологией искусственного интеллекта для врачебной диагностики болезней. Весь процесс может занять лишь несколько минут

Проконсультируйтесь у лучших врачей США, Германии, Кореи и других стран, не выходя из дома.

Доступно с:
— компьютеров
— планшетов
— телефонов

Лечиться за рубежом? Здесь можно узнать о лучших зарубежных больницах и врачах

Разработано профессионалами